根据“读卖新闻”的统计，废除国家核电设施的总成本 - 不包括福岛第一核电站和其他在建设施 - 估计约为6.72万亿日元。评估仅包括拆除目前可以估算费用的核电设施。
在这些估算中，日本核燃料有限公司(JNFL)在青森县六所市建造的废核燃料后处理厂的关闭成本最高，为1.6万亿日元。
估计53个商业核反应堆退役的费用总计约为3.58万亿日元，平均每个反应堆的费用为577亿日元。在53个反应堆中，有19个反应堆被安排或可能被废弃。
在53个反应堆退役过程中产生的低放射性废物(不包括乏核燃料)预计总量为487,140吨，平均每个反应堆9,191吨。
该计数不包括对正在建设中的核电厂进行评估的评估以及东京电力公司控股公司的福岛第一核电站被大东方摧毁的第1,2,3和4号反应堆的评估2011年的日本地震 - 目前难以估计数字。
关闭非商业用途核电设施的费用总计约为3.66万亿日元。其中，日本原子能机构拥有的79座核设施退役的费用估计总计约为1.9万亿日元，其中包括用于关闭茨城县东海村核燃料后处理厂的7,700亿日元。
JNFL表示，包括六所村核燃料后处理厂在内的五个设施的退役成本估计为1.73万亿日元。
后处理厂的规模如此之大，以至于潜在的放射性废物的数量可能会增加，因此使这种设施退役的成本变得巨大。
在2017年修订的核反应堆和其他核反应堆法律中，核电厂运营商有义务在2018年底之前发布废弃核电设施的执法政策 - 例如退役设施的估计费用和放射性数量拆除后会产生的废物。
国际原子能机构于2016年向日本政府提交了一份报告，其中要求释放退役核设施的政策。
