在考虑增加植物总生物量(所有木质纤维素植物生物量)的能力时，南非具有巨大的生物燃料潜力。根据保守估计，南非每年生产约1,800万吨农业和林业残留物。南非生物燃料目标2008 - 2013年根据工业生物燃料战略(2007年)，国家液体燃料供应的固定渗透率为2%，相当于每年4亿升。当考虑将这种植物生物质的50-70%用于第二代时生化和热化学技术，南非有可能用目前的液体化石燃料替代品(目前为21.2 BL /年)替代可再生生物燃料。然而，南非唯一的实际活动是投资4.37亿美元。工业发展公司(IDC)和能源开发公司(EDC)参与了两个生物燃料项目，这些项目将从甘蔗和甜菜中共同生产1.9亿升生物乙醇。
沼气
南非 的废物第三个国家废物基准显示了2011年南非产生的废物量。
| 废物导管[7] | 以百万吨计 | 在％ | 回收 |
| 产生的废物总量 | 108 | ||
| 在垃圾填埋场处置 | 98 | ||
| 危险废物' | 1 | ||
| 未分类废物：处理的最低要求，
危险废物的分类和处置（DWAF，1998）是指高容量产生的相对较低的危险废物（粉煤灰和灰尘，底灰，炉渣，盐水，矿物废物，污水污泥等） |
48 | 44 | |
| 一般废物：指不会对健康或环境构成直接危害或威胁的废物，包括：生活垃圾，建筑和拆除垃圾; 商业浪费; 和惰性废物。 | 59 | 55 | 10 |
| 其他（主要是工业生物质废物） | 36 | 61 | 0 |
| 不可回收的一般城市垃圾 | 8 | 35 | 0 |
| 可回收废物（此类别包括塑料，纸张，玻璃，金属和轮胎）。 | 7,4 | 10 | |
| 建筑和拆迁废物 | 4.7 | 20 | 16 |
| 有机废物 | 3 | 13 | 35 |
产生的食物垃圾
|
9
|
商业和工业废物类别的废物已被排除在生成的一般废物总量之外，以避免在基线报告中重复计算(DEA，2012)。废物管理仍然在很大程度上依赖于垃圾填埋场80-90%的废物。在南非，垃圾填埋仍然是最便宜的垃圾处理选择，尽管成本在增加。国家废物管理战略制定了雄心勃勃的目标，到2016年建立2600家中小企业(SME)和69000个废弃物新工作岗位。有很多机会可以增加废物回收，并从垃圾填埋场转移废物。这将需要为这些项目提供创新筹资模式，并为增加非正规部门和私营部门的贡献提供机会。[8] 沼气 由于监管框架的变化，南非越来越多地使用沼气，许多沼气池已经完工或计划完成。这与政府对可再生能源生产的激励和增加废物管理成本以及更严格的法规有关。 REI4P REIPPPP取代了关税计划中的可再生能源饲料计划，其中容量超过5兆瓦的场地的潜在生产者必须投标，而关税最低的生产者获胜。招标每两年进行一次。这为沼气和垃圾填埋提供了潜在的财务和运营支持。正在为5兆瓦以下的项目开发一个名为“小型项目IPP采购计划”的单独计划。美国能源部发布了小规模可再生能源项目的信息申请文件(2012年6月15日)。[9] 行业协会南部非洲沼气工业协会(SABIA)是一个公共的非营利组织，其唯一目标是促进南部非洲沼气工业的可持续增长，并有可能产生2500兆瓦的电力。该协会于2013年第一季度启动，目前正在建立自己。目前，SABIA有12个企业会员。2013年10月，SABIA组织了第一届沼气国家会议。
